西南大學研發出全球首張油菜液相育種芯片
人民網重慶9月29日電 (劉政寧、周小平、實習生陳亦豪)生物芯片作為生物育種關鍵技術,從源頭上決定種業科技水平和國家糧食安全。29日,西南大學發布消息,該校歷經八年,成功研發出全球首張油菜液相育種芯片——油菜50K液相育種芯片。
西南大學研發出全球首張油菜液相育種芯片。西南大學供圖
“油菜液相育種芯片對于大多數人而言,是陌生的。油菜、液相、育種芯片,這些詞我們挨著拆分來解釋,大家就很容易明白了。”西南大學農學與生物科技學院教授盧坤解釋。
據了解,種子創新是推動農業發展的核心動力,生物育種則是生物農業的首要方向。隨著分子設計育種成為引領作物遺傳改良的前沿技術,越來越多的研究者希望借助基因組測序、多組學分析、生物信息學的利器探索基因調控奧秘,提高育種效率。
正因如此,近年來,育種芯片的研發,也成為育種技術創新的重要賽道。
盧坤解釋,育種芯片和傳統意義上手機電腦等工業芯片不同,是生物物種基因檢測的重要工具,通過生物芯片可以讀取生物樣本DNA數據。簡單來說,育種芯片可讓研究人員了解,這類種子的大部分特性,從而指導重要品種培育。
據了解,育種芯片的形式大致分為固相芯片和液相芯片兩類。盧坤介紹,液相芯片在價格上極具優勢。從原理來講,傳統的固相芯片是基于熒光檢測,根據熒光強弱進行反應。由于反應位點固定,且以板為單位進行使用,即使只有效使用了其中一個芯片單元,都會造成整板芯片報廢,這在無形之中增加了研發成本。而液相芯片是基于DNA的捕獲,然后再進行測序,它對同一個位置進行了多次的測序。準確率不僅更高,且位點設計更為靈活,成本價格也僅占固相芯片的1/5。
“油菜過去有育種芯片,但是不是液相芯片;液相芯片有其他領域,但是不是針對油菜。但油菜液相育種芯片則是全球首張。”盧坤介紹,該團隊歷時八年,前期對全球588份有代表性的油菜品種進行了全基因重測序,挖掘出500萬多個SNP位點,然后從中篩選了5萬多個位點,設計了這款液相育種芯片。該芯片能為油菜靶向捕獲測序、遺傳分析和基因組育種提供基因組學資源。盧坤介紹,之所以聚集油菜領域,是因為油菜作為我國重要的油料作物,每年為國家提供50%以上的國產食用油,對擴大油料生產,保障國家糧油安全有重要意義。
據悉,育種從古至今,已經經歷了四代變革。第一代是人類將作物馴化為栽培品種;第二代是常規育種,如雜交育種;第三代是分子標記輔助選擇育種;第四代是智能化生物育種,以全基因組選擇和基因組設計育種的方式獲得新品種。
盧坤表示,油菜液相育種芯片的研發只是一個中間環節,前期團隊完成了油菜全基因組重新測序,鑒定出全球油菜的上百萬個變異位點。未來,團隊將基于該芯片構建智慧設計育種平臺,利用平臺,設計好基因型,培育出國家和農民需要的新品種。
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